生命科学论文综述——第一回 细胞外囊泡-基于PS亲和法的论文及其背后的故事-

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本文由富士胶片和光纯药 生物制品推进部 寅嶋崇 攥写



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本专栏旨在以第三方视角,梳理和分析全球研究人员及企业使用FUJIFILM Wako产品的应用场景,以及基于实际应用的科研成果。

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细胞外囊泡(Extracellular Vesicles,EV)是由脂质双分子层包裹的囊泡,直径约 100 μm。自1946 年Chargaff 等学者揭示其存在以来,迄今已逾 80 年。EV作为细胞源性的信号传递分子备受关注,其内部不仅含有蛋白质,还包含核酸(DNA、RNA)、脂质、糖链及代谢物,可助力探索包括癌症在内的多种人类疾病标志物(生物标志物)。自发现EV以来,研究核心均围绕阐明其结构与特性展开,但是EV的定义仍不明确,至今依旧存在着多种纯化方法,且不同方法获得的EV特征不一。

作为本专栏的第一回,我们将聚焦于与 EV 携手前行的富士胶片和光纯药(FUJIFILM Wako),及其 EV 分离纯化试剂盒 MagCapture™ Exosome Isolation Kit Ver.2,揭开其背后的精彩故事。本文将分析业内具有代表性的论文,重点介绍 EV 的纯化方法,以及FUJIFILM Wako试剂盒的特征和魅力。


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MagCapture™ Exosome Isolation Kit Ver.2



正如开篇所述,在多种EV纯化方法并存的情况下,研究人员通常会思考“究竟哪种纯化方法最为优越?“。基于相同的出发点,有的研究验证并比较了多种纯化方法,展示了各自优势的实验证据。接下来,将为大家介绍这篇论文。

Patil 等人 ¹)的研究专注于 EV纯化方法,颇具价值。研究人员对目前常见的 9 种 EV 纯化方法进行了系统性的验证及全面评估,评估指标包括粒径均一性、纯度以及蛋白质组学分析结果,同时基于离心分离、粒径尺寸、沉淀、静电相互作用和亲和法五类纯化原理进行分析。


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结果显示,即使是基于相同纯化原理的方法所获得的EV性能也存在差异。超速离心法(UC)和密度梯度离心法(DGUC)均需依赖超速离心设备进行操作,其中DGUC法因需制备密度梯度层,存在操作难度大,处理通量低且耗时长的问题。数据显示UC法富集的 EV 回收率虽高,但纯度稍低;DGUC法富集的EV纯度很高,但回收率低。尺寸排阻色谱法(SEC)与聚合物沉淀法无需专用实验设备,操作简便,特点是富集的EV 回收率高,但纯度稍低。而基于静电相互作用的纯化方法,以及亲和法之一的PS 亲和法(MagCapture™ Exosome Isolation Kit Ver.2)在所有评估指标上均表现优异,作为EV富集法效果显著。该方法尤其适用于少量血浆样本的高通量处理,以及生物标志物的发现研究。

 


关于利用EV探索中枢神经系统与癌症生物标志物的研究,本文将分别介绍以突触核蛋白病、膀胱癌为研究对象的相关论文。

在中枢神经系统领域,Miki 等人2)的研究阐述了异常 α- 突触核蛋白(α-Syn)在多系统萎缩(MSA)中导致EV释放受损的机制。通过MSA模型小鼠的转录组实验,筛选出10种可能与 α- Syn存在相互作用的囊泡转运相关蛋白,包括突触结合蛋白 13(SYT13)。结果显示,其中 SYT13是唯一同时整合入分别与MSA和路易体痴呆(DLB)密切相关的胶质细胞胞浆包涵体及路易小体的蛋白。值得关注的是,SYT13与磷酸化 α- Syn的结合能力强于内源性α- Syn,且还能与SYT1及可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体(SNARE)结合形成复合物。

通过神经退行性疾病研究模型中常用的“SH-SY5Y细胞”进行的实验表明,SYT13 通过与 SYT1 及 SNARE相互作用,会抑制EV的释放量,这一现象与MSA和DLB中 EV 释放减少的病理特征相吻合。

这一系列实验所得的EV 相关证据,均使用FUJIFILM Wako的可特异性纯化磷脂酰丝氨酸 (PS)阳性EV的试剂盒(MagCapture™ Exosome Isolation Kit Ver.2),并通过CD9、CD81、CD63等已知的EV标志物进行定量分析,证实SYT13 与MSA及DLB密切相关。

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在肿瘤研究领域,Tomiyama 等人3)的研究尝试通过EV探索膀胱癌标志物。该研究以膀胱癌患者尿液来源的 EV 为样本,通过鸟枪法蛋白质组学技术(采用串联质谱标签 [TMT] 联合液相色谱 - 串联质谱 [LC-MS/MS] 技术)鉴定出 1960 种标志物候选蛋白,并从中进一步筛选出 17 种细胞质来源的EV蛋白。

在病例-对照研究中,对每组50例的 EV 样本进行靶向蛋白质组学(选择反应监测/多反应监测,SRM/ MRM)分析,最终筛选出10 个在膀胱癌中明显高表达的靶点。最终,EIF2S1被选为诊断性能最佳的靶向标志物,在膀胱癌细胞株(T24 和 5637)中敲低EIF2S1,可显著抑制细胞增殖。细胞株的EV纯化使用FUJIFILM Wako的试剂盒(MagCapture™ Exosome Isolation Kit Ver.2) ,并提前确认了EIF2S1 的表达。基于相似的研究方案,FUJIFILM Wako的外泌体提取试剂盒有望广泛应用于肿瘤标志物的筛选研究。

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最后,介绍一篇探讨使用EV进行分析时样本处理方法的论文。器官、组织及细胞分泌的 EV 会随血液循环至外周部位,基于此,有研究尝试使用少量外周血或尿液等低侵入性样本,进一步开展蛋白质组学及RNA 分析。村冈等人4)使用FUJIFILM Wako的试剂盒(MagCapture™ Exosome Isolation Kit Ver.2)从血浆、血清这类外周样本中纯化EV,成功鉴定出 4,079 种EV特异性蛋白,还从血液样本中进一步鉴定出健康人群来源的EV 中普遍存在的组织特异性蛋白群。为从此类实验中获取可靠证据,通常需处理高通量的微量样本。村冈等人5)将这一技术难点列为研究重点,指出能处理磁性颗粒的自动化实验设备(AutoPure-Mini、Maxwell®、KingFisher™),采用多孔板可实现对高通量微量临床样本中的EV进行自动化处理,从而实现高效的蛋白质组学分析。这种自动化蛋白质组学用的 EV 样本制备法,可有效用于大规模生物标志物的开发、验证,以及常规检测的样本处理。FUJIFILM Wako基于 PS 亲和法研发的试剂盒(MagCapture™ Exosome Isolation Kit Ver.2)也有望在该领域的相关研究与应用中发挥重要作用。


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自动提取设备Auto-Pure Mini



◆参考文献


1. 

Suresh, P. S. and Zhang, Q.: Proteome Res., 24 (6), 2956 (2025).
Comprehensive Comparison of Methods for Isolation of Extracellular Vesicles from Human Plasma

2. 

Miki, Y. et al.: Neurodegener., 14 (1), 32 (2025).
Abnormal α-synuclein binds to synaptotagmin 13, impairing extracellular vesicle release in synucleinopathies

3.

Tomiyama, E. et al.: Cancer Med., 14 (10), e70964 (2025).
EIF2S1 in Urinary Extracellular Vesicles as a Novel Diagnostic Marker for Bladder Cancer

4.

Muraoka, S. et al.: iScience25 (4), 104012 (2022).
Comprehensive proteomic profiling of plasma and serum phosphatidylserine-positive extracellular vesicles reveals tissue-specific proteins

5.

Muraoka, S. et al.: ACS Omega7 (45), 41472 (2022).
Automated Proteomics Sample Preparation of Phosphatidylserine-Positive Extracellular Vesicles from Human Body Fluids



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