蛋白质的提取是蛋白质研究初期的重要步骤,应根据样品和蛋白质选择合适的提取方法。
FUJIFILM Wako推出的蛋白质提取试剂盒“LysoPure™ Nuclear and Cytoplasmic Extractor Kit”无论是性能还是性价比均广受好评,该产品可用于从细胞或组织中提取蛋白质。
蛋白质各种提取方法的差异
蛋白质的提取是蛋白质提取和纯化过程中第一个关键步骤,常见研究样品有动物、植物和微生物等,需根据样品类型选择合适的提取方法。
◆什么是蛋白质的提取/纯化?
蛋白质提取/纯化通常分为3步:
1. 样品前处理并提取总蛋白
2. 分离和浓缩目标蛋白
3. 去除干扰物质和杂质(净化提取的蛋白)
细胞破碎和裂解并提取蛋白非常重要,它可能会影响最终获得的蛋白质的产量和质量1)。
◆蛋白提取相关的3个重要事项
为了高效回收目标蛋白,需重点关注以下3个要点
1.样品类型
2.目标蛋白的表达位置
3.提取过程中蛋白质的稳定性(蛋白酶抑制)
① 样品类型
哺乳动物组织
从组织中提取蛋白质时,需使用超声波或匀浆器破碎组织。
动物细胞、组织培养细胞
使用含有表面活性剂的试剂裂解由脂质双分子层组成的细胞膜,提取蛋白质。
大肠杆菌、酵母、植物
大肠杆菌、酵母和植物都具有细胞壁,通常通过物理法破碎的酶解法消化细胞壁。
② 目标蛋白的表达位置
某些蛋白质会位于内质网、线粒体、细胞核或细胞膜中。在蛋白质提取过程中,通过去除非目标蛋白,选择性地保留目标蛋白含量较高的细胞组分,从而可回收高浓度的目标蛋白。FUJIFILM Wako可提供从不同细胞组分中提取蛋白质的蛋白质提取试剂。
蛋白质提取试剂
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 | 产品等级 |
Cell Lysis Buffer M | 100 mL | 基因研究用 | |
250 mL | |||
RIPA Buffer | 100 mL | 基因研究用 | |
250 mL | |||
LysoPure™ Nuclear and Cytoplasmic Extractor Kit | 100次用 | 蛋白质组学研究用 |
③ 提取过程中的蛋白质稳定性(蛋白酶抑制)
在蛋白质提取过程中,细胞结构遭到了破坏,导致细胞内蛋白酶的释放。若不进行处理,目标蛋白会被蛋白酶降解。
为避免蛋白降解,需提前在提取试剂或蛋白提取物中添加蛋白酶抑制剂。由于大部分蛋白酶在37°C左右达到最高活性,因此需确保提取过程使样本处于低温状态(0~4°C)。通常提取过程中需将样品和试剂置于冰上操作。
当目标蛋白是磷酸化蛋白时,除了蛋白酶抑制剂之外还需使用磷酸酶抑制剂,以及防止磷酸化蛋白质被去磷酸化。
蛋白酶抑制剂
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 | 产品等级 |
Protease Inhibitor Cocktail Set I , Animal-derived-free(for general use) (×100) | 1 mL用 | 细胞生物学用 | |
1 mL用×5 | |||
Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅲ DMSO Solution(EDTA free) (×100) | 1 mL | 细胞生物学用 | |
1 mL×5 | |||
Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅲ, DMSO Solution, Animal-derived-free(EDTA free) (×100) | 1 mL | 细胞生物学用 | |
1 mL×5 | |||
Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅳ, DMSO Solution(for Fungal and Yeast) (×100) | 1 mL | 细胞生物学用 | |
1 mL×5 | |||
Protease Inhibitor Cocktail Set V (EDTA free) (×100) | 1 mL用 | 细胞生物学用 | |
1 mL用×5 | |||
Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅶ DMSO Solution (for Histidine-tagged Protein) (×100) | 1 mL | 细胞生物学用 | |
1 mL×5 |
磷酸酶抑制剂
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 | 产品等级 |
Phosphatase Inhibitor Cocktail SolutionⅡ(×100) | 1 mL | 细胞生物学用 | |
Phosphatase Inhibitor Cocktail SolutionⅠ(×100) | 1 mL | 细胞生物学用 |
◆蛋白质的各类提取方法
以下将简要介绍蛋白质的提取方法。
超声波破碎
使用高频脉冲超声波破碎组织和细胞结构的过程称为超声波处理。将超声波探头浸入混合了提取试剂的样品悬液,通过利用超声波能量持续产生和破裂气泡来不断地冲击样品。处理中会产生热量,需一边冷却样品,一边不间断地进行超声波处理,防止样品悬液的温度上升。
匀浆器破碎
匀浆器常用于组织和培养细胞的破碎。使用称为“研杵”的棒按压样品以破碎细胞。按压的次数和速度影响破坏的效率。
Dounce匀浆器:圆形玻璃杵 + 玻璃管
Potter匀浆器:圆形或锥形特氟龙涂层杵 + 外管
FUJIFILM Wako可提供一次性高效匀浆器。
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 |
BioMasherⅠ 1.5ml microtube | 30 pcs | |
BioMasher 1.5ml microtube (with O-ring) | 50 Set×4 | |
BioMasher V, Non-sterile | 20 Sets | |
BioMasher V, EOG-sterile | 20 Sets | |
BioMasher SP | 40 tests | |
BioMasher SP,EOG-sterile | 40 tests |
法式压榨机
对50~200 mL 细胞悬液施加高压,使细胞通过狭窄的小孔以破碎细胞。
磁珠法破碎
磁珠可破碎细胞壁和细胞膜,常用于从有细胞壁的酵母中提取蛋白质。破碎效率主要取决于磁珠的质量和直径,需根据样品选择合适的磁珠。
研钵和研杵
使用研钵和研杵研磨并破碎样品。有时会先用液氮冷冻样品后再进行研磨。该技术通常用于破碎有纤维素和多糖组成的坚硬细胞壁的植物细胞。
冻融法
使用液氮、干冰或冷乙醇快速冷冻样品,然后在室温或37°C下解冻。冷冻过程中细胞膨胀形成冰晶,从而可破碎细胞并提取蛋白质,这个过程通常至少需要重复2次以上直到充分破碎。冻融法常用于从细菌和哺乳动物细胞中提取蛋白质。
酶消化法
可降解细胞壁和其他物质的酶可用于提取蛋白质,如溶菌酶用于大肠杆菌,纤维素酶和果胶酶用于植物。
此外,具有广泛溶菌活性的肽酶 Achromopeptidase®,其溶菌活性高于溶菌酶,可用于多种细菌。
溶菌酶
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 | 产品等级 |
Lysozyme, from Egg White | 1 g | 生化学用 | |
5 g | |||
10 g |
纤维素酶
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 |
Macerozyme R-10 (VIAL) | 5 Vials | |
Cellulase ONOZUKA RS (VIAL) | 5 Vials | |
Cellulase ONOZUKA R-10 (VIAL) | 5 Vials | |
Cellulase ONOZUKA RS | 10 g | |
Cellulase ONOZUKA R-10 | 10 g | |
Macerozyme R-10 | 10 g |
Achromopeptidase®
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 | 产品等级 |
Achromopeptidase, Crude, Lytic Enzyme | 1 g | 生化学用 | |
Achromopeptidase, Purified, Lytic Enzyme (TBL-1) | 8 mg | 生化学用 |
渗透冲击法
将细胞置于低渗透压的溶液中,引起细胞渗透性休克,由此提取蛋白质。该方法的优势在于细胞内细胞器保持完整,因此蛋白酶活性较低。
基于表面活性剂的方法
表面活性剂是由亲水性头基和疏水性尾基组成的两亲性分子,具有脂肪族或芳香族特性。通过使用表面活性剂可以提高疏水性蛋白质的溶解性。一般直接将其添加至细胞裂解液中,但纯化膜蛋白时,需在膜组分制备后添加表面活性剂。
表面活性剂分为离子型(带阴离子或阳离子电荷)、非离子型(不带电荷)、两性离子型(含正电荷和负电荷基团,但净电荷为0)。根据样品制备过程选择不同的表面活性剂,通常使用非离子型或两性离子型表面活性剂。
◆参考文献
1. “Protein Experiment Notebook vol.1 4th ed.”ed. by Okada, M., Miyazaki, K., Yodosha, (2011). (日文)
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