【Wako小课堂】蛋白质提取方法概述,从0开始了解蛋白质提取

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蛋白质的提取是蛋白质研究初期的重要步骤,应根据样品和蛋白质选择合适的提取方法。

FUJIFILM Wako推出的蛋白质提取试剂盒LysoPure™ Nuclear and Cytoplasmic Extractor Kit无论是性能还是性价比均广受好评,该产品可用于从细胞或组织中提取蛋白质。

 

蛋白质各种提取方法的差异

蛋白质的提取是蛋白质提取和纯化过程中第一个关键步骤,常见研究样品有动物、植物和微生物等,需根据样品类型选择合适的提取方法。


◆什么是蛋白质的提取/纯化

蛋白质提取/纯化通常分为3步:

1. 样品前处理并提取总蛋白

2. 分离和浓缩目标蛋白

3. 去除干扰物质和杂质(净化提取的蛋白)

细胞破碎和裂解并提取蛋白非常重要,它可能会影响最终获得的蛋白质的产量和质量1)


◆蛋白提取相关的3个重要事项

为了高效回收目标蛋白,需重点关注以下3个要点

1.样品类型

2.目标蛋白的表达位置

3.提取过程中蛋白质的稳定性(蛋白酶抑制)


① 样品类型

哺乳动物组织

从组织中提取蛋白质时,需使用超声波或匀浆器破碎组织。


动物细胞、组织培养细胞

使用含有表面活性剂的试剂裂解由脂质双分子层组成的细胞膜,提取蛋白质。

 

大肠杆菌、酵母、植物

大肠杆菌、酵母和植物都具有细胞壁,通常通过物理法破碎的酶解法消化细胞壁。


② 目标蛋白的表达位置

某些蛋白质会位于内质网、线粒体、细胞核或细胞膜中。在蛋白质提取过程中,通过去除非目标蛋白,选择性地保留目标蛋白含量较高的细胞组分,从而可回收高浓度的目标蛋白。FUJIFILM Wako可提供从不同细胞组分中提取蛋白质的蛋白质提取试剂。


蛋白质提取试剂

产品编号

产品名称

产品规格

产品等级

038-21141

Cell Lysis Buffer M
细胞溶解缓冲液M

100 mL

基因研究用

034-21143

250 mL

182-02451

RIPA Buffer
RIPA缓冲液

100 mL

基因研究用

188-02453

250 mL

295-73901

LysoPure™ Nuclear and Cytoplasmic Extractor Kit
细胞核和胞质蛋白提取试剂盒

100次用

蛋白质组学研究用


③ 提取过程中的蛋白质稳定性(蛋白酶抑制)

在蛋白质提取过程中,细胞结构遭到了破坏,导致细胞内蛋白酶的释放。若不进行处理,目标蛋白会被蛋白酶降解。

为避免蛋白降解,需提前在提取试剂或蛋白提取物中添加蛋白酶抑制剂。由于大部分蛋白酶在37°C左右达到最高活性,因此需确保提取过程使样本处于低温状态(0~4°C)。通常提取过程中需将样品和试剂置于冰上操作。

当目标蛋白是磷酸化蛋白时,除了蛋白酶抑制剂之外还需使用磷酸酶抑制剂,以及防止磷酸化蛋白质被去磷酸化。


蛋白酶抑制剂

产品编号

产品名称

产品规格

产品等级

165-26021

Protease Inhibitor Cocktail Set I ,

Animal-derived-free(for general   use) (×100)
蛋白酶抑制剂混合物I,无动物源成分(通用),(x 100), 冻干粉

1 mL用

细胞生物学用

161-26023

1 mL用×5

163-26061

Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅲ DMSO Solution(EDTA free)   (×100)
蛋白酶抑制剂混合物III, DMSO溶液(无EDTA),(x 100)

1 mL

细胞生物学用

169-26063

1 mL×5

162-28231

Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅲ, DMSO Solution,   

Animal-derived-free(EDTA free) (×100)
蛋白酶抑制剂混合物III, DMSO溶液,无动物源(无EDTA),(x 100)

1 mL

细胞生物学用

168-28233

1 mL×5

164-28671

Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅳ, 

DMSO Solution(for Fungal and   Yeast) (×100)
蛋白酶抑制剂混合物IV,DMSO溶液(用于真菌和酵母)( ×100)

1 mL

细胞生物学用

160-28673

1 mL×5

162-26031

Protease Inhibitor Cocktail Set V (EDTA free) (×100)
蛋白酶抑制剂混合物V (无EDTA),(x 100), 冻干粉

1 mL用

细胞生物学用

168-26033

1 mL用×5

167-26101

Protease Inhibitor Cocktail Set Ⅶ DMSO Solution

(for Histidine-tagged Protein) (×100)
蛋白酶抑制剂混合物VII,DMSO溶液(His-tagged蛋白用)

1 mL

细胞生物学用

163-26103

1 mL×5


磷酸酶抑制剂

产品编号

产品名称

产品规格

产品等级

160-24371

Phosphatase Inhibitor Cocktail SolutionⅡ(×100)
磷酸酶抑制剂混合溶液 II (×100)

1 mL

细胞生物学用

167-24381

Phosphatase Inhibitor Cocktail SolutionⅠ(×100)
磷酸酶抑制剂混合溶液 I(×100)

1 mL

细胞生物学用


◆蛋白质的各类提取方法

以下将简要介绍蛋白质的提取方法。

超声波破碎

使用高频脉冲超声波破碎组织和细胞结构的过程称为超声波处理。将超声波探头浸入混合了提取试剂的样品悬液,通过利用超声波能量持续产生和破裂气泡来不断地冲击样品。处理中会产生热量,需一边冷却样品,一边不间断地进行超声波处理,防止样品悬液的温度上升。

 

匀浆器破碎

匀浆器常用于组织和培养细胞的破碎。使用称为“研杵”的棒按压样品以破碎细胞。按压的次数和速度影响破坏的效率。

Dounce匀浆器:圆形玻璃杵 + 玻璃管

Potter匀浆器:圆形或锥形特氟龙涂层杵 + 外管


FUJIFILM Wako可提供一次性高效匀浆器。

产品编号

产品名称

产品规格

385-21541

BioMasherⅠ 1.5ml microtube
一次性均质器BioMasherⅠ 1.5ml 微管

30 pcs

300-30763

BioMasher 1.5ml microtube (with O-ring)
BioMasher 1.5ml 微型管

50 Set×4

389-01281

BioMasher V, Non-sterile
BioMasher V,未灭菌

20 Sets

386-01291

BioMasher V, EOG-sterile
BioMasher V,EOG灭菌

20 Sets

384-02571

BioMasher SP
一次性匀质器BioMasher SP

40 tests

381-02581

BioMasher SP,EOG-sterile
BioMasher SP,EOG灭菌

40 tests


法式压榨机

对50~200 mL 细胞悬液施加高压,使细胞通过狭窄的小孔以破碎细胞。


磁珠法破碎

磁珠可破碎细胞壁和细胞膜,常用于从有细胞壁的酵母中提取蛋白质。破碎效率主要取决于磁珠的质量和直径,需根据样品选择合适的磁珠。

 

研钵和研杵

使用研钵和研杵研磨并破碎样品。有时会先用液氮冷冻样品后再进行研磨。该技术通常用于破碎有纤维素和多糖组成的坚硬细胞壁的植物细胞。

 

冻融法

使用液氮、干冰或冷乙醇快速冷冻样品,然后在室温或37°C下解冻。冷冻过程中细胞膨胀形成冰晶,从而可破碎细胞并提取蛋白质,这个过程通常至少需要重复2次以上直到充分破碎。冻融法常用于从细菌和哺乳动物细胞中提取蛋白质。

 

酶消化法

可降解细胞壁和其他物质的酶可用于提取蛋白质,如溶菌酶用于大肠杆菌,纤维素酶和果胶酶用于植物。

此外,具有广泛溶菌活性的肽酶 Achromopeptidase®,其溶菌活性高于溶菌酶,可用于多种细菌。


溶菌酶

产品编号

产品名称

产品规格

产品等级

123-06721

Lysozyme,   from Egg White
溶菌酶,蛋白来源

1 g

生化学用

129-06723

5 g

127-06724

10 g


纤维素酶

产品编号

产品名称

产品规格

639-49771

Macerozyme   R-10 (VIAL)
离析酶R-10(瓶装)

5 Vials

632-49761

Cellulase ONOZUKA RS (VIAL)
纤维素酶ONOZUKA RS (瓶装)

5 Vials

635-49751

Cellulase ONOZUKA R-10 (VIAL)
纤维素酶ONOZUKA R-10 (瓶装)

5 Vials

639-01431

Cellulase ONOZUKA RS
纤维素酶ONOZUKA RS

10 g

636-01441

Cellulase ONOZUKA R-10
纤维素酶ONOZUKA R-10

10 g

635-02631

Macerozyme R-10
离析酶R-10

10 g


Achromopeptidase®

产品编号

产品名称

产品规格

产品等级

014-09661

Achromopeptidase,   Crude, Lytic Enzyme
无色肽酶,粗制,细胞裂解酶

1 g

生化学用

019-28531

Achromopeptidase,   Purified, Lytic Enzyme (TBL-1)
无色肽酶,精制,细胞裂解酶 (TBL-1)

8 mg

生化学用


渗透冲击法

将细胞置于低渗透压的溶液中,引起细胞渗透性休克,由此提取蛋白质。该方法的优势在于细胞内细胞器保持完整,因此蛋白酶活性较低。

 

基于表面活性剂的方法

表面活性剂是由亲水性头基和疏水性尾基组成的两亲性分子,具有脂肪族或芳香族特性。通过使用表面活性剂可以提高疏水性蛋白质的溶解性。一般直接将其添加至细胞裂解液中,但纯化膜蛋白时,需在膜组分制备后添加表面活性剂。

表面活性剂分为离子型(带阴离子或阳离子电荷)、非离子型(不带电荷)、两性离子型(含正电荷和负电荷基团,但净电荷为0)。根据样品制备过程选择不同的表面活性剂,通常使用非离子型或两性离子型表面活性剂。

 

◆参考文献

1. “Protein Experiment Notebook vol.1 4th ed.”ed. by Okada, M., Miyazaki, K., Yodosha, (2011). (日文)


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