质谱级赖氨酰肽链内切酶
Lysyl Endopeptidase®
本产品是质谱分析前处理时常用的蛋白分解酶即赖氨酰肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和 Lys-X 化合物的酶合成。若同时使用赖氨酰肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸基团的多肽,增加多肽的数量。产品已按照使用习惯做成小包装,是方便使用的冷冻干燥品。20 μg/支可用于100-200个样品的凝胶内消化。
来源:细菌
外观:冻干粉(包含2 mmol/L Tris-HCl 缓冲液,pH8)
活性:0.03~0.07 AU/vial
分子量:27,000(琼脂糖过滤),30,000(SDS-PAGE)
溶解性:溶于水或缓冲液
稳定性:溶解于 pH 值 5.0-12.0 的 Tris 缓冲液中,可在4℃稳定保存2年;在 pH 值 6.0-11.0、30℃时能稳定保存,但温度超过50℃时不稳定。
最适pH值:9.0~9.5
等电点:6.9~7.0
底物特异性:
可水解底物——Tos-Lys-OMe、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA
不可水解底物——Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNA、Arg-pNA
抑制剂:DFP、PMSF、TLCK
◆特点
● 高特异性、高蛋白质消化率、适用于蛋白质谱分析
● 提高裂解效率、增加肽段数量
● 根据使用量特意制备小包装,方便使用
◆应用
分别采用胰蛋白酶(Tp)、赖氨酰肽链内切酶(Lys-C)和 Tp与Lys-C 联用进行胶内酶切的效果比较。
牛血清蛋白 BSA 的条带(100 ng)通过 SDS-PAGE 获得,然后分别用 Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp 进行酶切,再用 MALDI-TOFMS 法进行分析。
这些蛋白酶的实验效果见下表。
表 1:Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp 的结果对照
这些结果表明 Lys-C 酶解的漏切位点数(Missed Cleavage)最少。Tp 酶解时加入 Lys-C 后,漏切位点数有所降低,同时,可以鉴定出更多的多肽。
Tp | Lys-C | Lys-C+Tp | |
裂解位点 | 精氨酸和赖氨酸的C端 | 赖氨酸的C端 | 精氨酸和赖氨酸的C端 |
漏切位点数 (漏切位点所占比例) | 多(8%) | 很少(0%) | 少(3%) |
鉴定出的多肽数量 | 17 | 19 | 22 |
胰蛋白酶(Tp)(图 a)和赖氨酰肽链内切酶(Lys-C)+Tp( 图 b)酶切后的质谱结果对照图。
Lys-C+Tp 酶切后,可以在 m/z=2000 时得到吸收峰,而单独的 Tp 酶切在 m/z=2000 时没有吸收峰。该结果表明 Lys-C 可以提高测序覆盖度。
( 数据由大阪医疗中心和妇婴健康研究所Y. Wada 博士提供 )
赖氨酰肽链内切酶
赖氨酰肽链内切酶,最初由 Masaki 等人从土壤细菌中分离得到。该酶可以特异性剪切赖氨酸残基C末端和S-氨乙基半胱氨酸残基的肽键,用于蛋白测序和 Lys-X 化合物的酶催化合成。该酶稳定性高,在4M尿素或 0.1% SDS 溶液中 30℃ 孵育6小时之后,仍然拥有完整的生物活性。
外观 | 冻干粉(包含ca. 10% Tris-HCl buffer,pH 8) | 活性 | 见包装 |
分子量 | 27,000(凝胶过滤);30,000 (SDS-PAGE) | 溶解性 | 易溶于水或缓冲液 |
最佳pH | 9.0-9.5(酰胺酶的最佳活性 pH) | 等电点 | 6.9-7.0 |
抑制剂 | DFP、PMSF、TLCK | 来源 | 细菌 |
稳定性 | 溶于pH 值 5.0-12.0 的缓冲液中,可于4℃稳定保存。溶于pH 值 6.0-11.0 的缓冲液中,可于30℃稳 定保存,但是50℃及以上不稳定。 | ||
单位定义 | 一单位酰胺酶(AU)指在30℃ pH 9.5 时每分钟产生1 μmol 对硝基苯胺所需的酶量。 | ||
底物特异性 | 水解底物:Tos-Lys-Ome、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA | ||
非水解底物:Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNa、Arg-pNA |
※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。
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实验方法
1. 试剂:
A.0.2 mol/L AMP 缓冲液,pH值 9.5
溶解 4.2 g 的2-氨基-2-甲基-1,3-丙二醇于 150 mL 的水中,加入1 mol/L HCl 调 pH 值至 9.5,再加水使体积至 200 mL。
B.2.5 mmol/L 底物溶液
溶解 22.6 mg 的α-Benzoyl-DL-lysine-p-nitroanilide Hydrobromide(产品编号:024-19731)于 20 mL 水中。
C. 2 mmol/L Tris-HCl 缓冲液,pH8
溶解 0.24 mg的2-氨基-2-羟甲基-1,3-丙二醇于 900 mL 水中,加入 0.1 mol/L HCl 调pH值至8,再加水使体积至1 L。
D. 酶溶液
溶解1vial 的赖氨酰肽链内切酶于1mL 的溶剂C中,可直接加入。
E. 终止溶液
将 55 mL 水和 45 mL 乙酸混合均匀。
2. 步骤
试剂 | 检测样品 | 空白对照 |
A | 2.6 mL | 2.6 mL |
B | 0.3 mL | 0.3 mL |
30℃ 预培养5分钟 | ||
D | 0.1 mL | - |
C | - | 0.1 mL |
立即混合均匀,30℃ 预培养25分钟 | ||
E | 1.0 mL | 1.0 mL |
3. 单位的定义
酰胺酶单位是指 30℃、pH 9.5 时,每分钟产生1μmol 对硝基苯胺的酶量。
AU/vial = [(a-b) / 25] × (1/9.62) × (4.0/0.1)
a. 检测样品中的吸光度
b. 空白对照中的吸光度
胶内酶切的实验操作流程
用聚硅酮处理的微量离心管和吸管端防止捕获任何蛋白。使用质谱分析用凝胶染色试剂盒,例如银染剂 MS 试剂盒(产品编号:299-58901)和负凝胶染色 MS 试剂盒(产品编号:293-57701)
1. 电泳分离蛋白质样品;
2. 从凝胶中切割蛋白质片断并放入微量离心管;
3. 使凝胶脱色(可使用质谱分析用凝胶染色试剂盒中的脱色溶液);
4. 加入300 μL 乙腈到试管里,搅拌器振荡 30 分钟;
5. 去除乙腈,用 Parafilm 膜覆盖微量离心管。
6. 在 Parafilm 膜上打出针孔,真空干燥 15 分钟;
7. 100 μL 10 mmol/L DTT 溶解于 100 mmol/L 碳酸氢铵,56℃恒温1小时。
8. 室温冷却后,用等量的 50 mM 碘乙酰胺溶解于 100 mmol/L 碳酸氢铵,暗处恒温 45 分钟并涡旋;
9. 用 100 μL 100 mmol/L 碳酸氢铵洗涤凝胶片段 10 分钟;
10. 用 300 μL 乙腈干燥凝胶片段 15 分钟;
11. 用 100 μL 100 mmol/L 碳酸氢铵溶胀凝胶片段 15 分钟;
12. 用 300 μL 乙腈再次干燥凝胶片段 15 分钟;
13. 去除液相,真空干燥凝胶片段 15 分钟;
14. 用 100 μL 赖氨酸内切酶溶液*在冰水浴中溶胀凝胶片段 45 分钟;
*赖氨酸内切酶稀释于 50 mmol/L Tris-HCl pH 8.5;
15. 去除 100 μL 赖氨酸内切酶溶液,将凝胶片段放在 37℃、10 μL 50 mmol/L Tris-HCl pH 8.5 中过夜;
16. 加入 50 μL 20mmol/L 碳酸氢铵 20 分钟内振荡凝胶片段3次抽提多肽;
17. 加入 5% 甲酸/50% 乙腈 20 分钟内振荡凝胶片段3次抽提多肽;
18. 如果需要用 Speed Vac. 浓缩多肽;
19. 用 ZipTip 脱盐和纯化多肽;
20. 如果需要用弱真空浓缩多肽至2 μL;
21. 加入基质进行质谱分析。
注意:根据细菌的生理和形态特征分类,产品来源为水解无色杆菌,但是最近细菌分类学将这种细菌鉴定为产酶溶杆菌。
保存:暗处-20℃保存
规格:20 μg×5 vial
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