磁珠型microRNA分离试剂盒
FUJIFILM Wako提供能使从Ago 免疫沉淀到RNA 提取等一系列实验操作简化的“microRNA Isolation Kit”系列。使用本系列试剂盒能简便地从人和小鼠的细胞或组织中提取Ago蛋白结合的microRNA以及靶mRNA,还能从培养上清、血清、血浆中提取游离Ago蛋白结合的microRNA。所提取到的RNA可以应用于qPCR、微阵列检测、NGS等下游实验。本系列包括采用磁珠的MagCapture™ microRNA Isolation Kit,以及采用了硅胶珠法的microRNA Isolation Kit。
MagCapture™ microRNA Isolation Kit(磁珠法)系列产品包括含抗人Ago2抗体(4G8)、抗小鼠Ago2抗体(2D4)、抗Ago1-4抗体(1G3)固相化磁珠这三种试剂盒,以及第四种——能结合任意抗体的Protein G磁珠。上述试剂盒全部采用磁珠法,可进行简易的免疫沉淀操作并获得良好的重复性。免疫沉淀后提取的RNA可进一步使用离心柱纯化,获得高纯度的RNA,若使用含有抗Ago抗体固定化磁珠的3种试剂盒,也可使用一步法更加简便地提取RNA(备注:RNA与磁珠不分离)。
◆试剂盒组成(例:Human Ago2, 10次用)
1. Anti-Human Ago2 Magnetic Beads Solution:600 μL×1瓶
2. Cell Lysis Solution:20 mL×1瓶
3. Washing Solution for IP:40 mL×1瓶
4. Elution Solution I for IP:500 μL×1瓶
5. Elution Solution II for IP:500 μL×1瓶
6. Binding Solution for Spin Column:2 mL×1瓶
7. Binding Enhancer for Spin Column:100 μL×1瓶
8. Washing Solution I for Spin Column:3 mL×1瓶
9. Washing Solution II for Spin Column:4 mL×1瓶
10. Elution Solution for Spin Column:1 mL×1瓶
11. Spin Column/Collection Tube:10瓶
◆操作示意图
◆MagCapture™ microRNA Isolation Kit,Human Ago2 使用例子(人)
提取人细胞株中的microRNA
通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(银染),检测使用本品(MagCapture™ microRNA Isolation Kit,Human Ago2)从人K562细胞(1×107 cells)中提取的microRNA(图1)。结果显示,本系列试剂盒可提取得到高纯度的microRNA。通过qPCR对miR-92a进行定量,比较使用本品和硅胶珠型产品(microRNA Isolation Kit,Human Ago2)提取的microRNA量(图2)。本系列试剂盒的离心柱法具有几乎与硅胶珠法相同的microRNA提取能力,而且一步法的microRNA提取能力比硅胶珠法更好。
图1. 对从人K562细胞中提取的microRNA的进行银染检测
图2. 比较从人K562细胞中提取的microRNA量
提取人血浆中的游离Ago2蛋白结合microRNA
以qPCR对miR-92a进行定量,比较使用磁珠型MagCapture™ microRNA Isolation Kit,Human Ago2和硅胶珠型产品从200 μL健康人混合血浆中提取的microRNA量。结果发现,本试剂盒中的离心柱法具有几乎与硅胶珠型产品相同的microRNA提取能力,而且一步法的microRNA提取量比硅胶珠型高(图3)。
图3. 比较从人血浆中提取的microRNA量
提取microRNA的靶标mRNA
向miR-122低表达的肝癌细胞株HepG2细胞(5×105 cells)导入人工合成的miR-122或调控的荧光素酶siRNA(Luc siRNA),提取了分别用磁珠型MagCapture™ microRNA Isolation Kit,Human Ago2和硅胶珠型产品制备的Ago2 IP RNA,以及用ISOGEN® 制备的total RNA。运用qPCR法比较各种RNA中含有的miR-122量(图4)与其靶标mRNA(Aldo A mRNA是miR-122靶标之一,以GAPDH内参作校正)量(图5)。与硅胶珠型产品一样,本品提取的RNA中富集了miR-122和Aldo A mRNA,因此,可以利用本品提取microRNA的靶标mRNA。另一方面,用ISOGEN® 制备的total RNA中的Aldo A mRNA会随着miR-122的增加而分解并减少。
图4. miR-122提取量的比较
图5. 靶标mRNA提取量的比较
◆MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Mouse Ago2 使用例子(小鼠)
从小鼠细胞株中提取microRNA
通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(银染),检测用本试剂盒(MagCapture™ microRNA Isolation Kit,Mouse Ago2)从小鼠P388D1细胞(2×107 cells)中提取的microRNA(图1)。结果显示,本品能提取出高纯度的microRNA。另外,以qPCR法对miR-92a进行定量,比较使用硅胶珠型产品(microRNA Isolation Kit,Mouse Ago2)提取到的microRNA量(图2)。结果发现,本品的离心柱法具有与硅胶珠型产品几乎同样的microRNA提取能力,而一步法的microRNA提取能力比硅胶珠型产品更好。
图1. 对从小鼠P388D1细胞中提取的microRNA的进行银染检测
图2. 比较从小鼠P388D1细胞中提取的microRNA量
从大鼠血浆中提取游离Ago2蛋白结合microRNA
通过qPCR对miR-92a进行定量,比较使用本品以及硅胶珠型产品从200μL大鼠血浆中提取到的microRNA量。本品的离心柱法具有与硅胶珠型产品几乎同样的microRNA提取能力,而一步法的microRNA提取能力比硅胶珠型产品更好(图3)。
图3. 比较从大鼠血浆中提取的microRNA量
◆MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Ago 1–4 使用例子(人)
提取Ago1–4结合microRNA
用各种Ago1、Ago2、Ago3、Ago4特异性抗体进行微阵列检测分析免疫沉淀后HeLa中的各个RNA组分,结果显示,Ago2中捕获了大量miR-22和miR-16,而Ago1、Ago3、Ago4中则捕获了大量的miR-1260b和miR-4286(表1)。
信号强度 | 信号比 | ||||||
名称 | Ago1 IP | Ago2 IP | Ago3 IP | Ago4 IP | Ago2/Ago1 | Ago2/Ago3 | Ago2/Ago4 |
hsa-miR-22 | 3521.4 | 21696.5 | 3771.2 | 292.4 | 6.16 | 5.75 | 74.2 |
hsa-miR-16 | 6886.3 | 28527.2 | 5013.4 | 582.5 | 4.14 | 5.69 | 48.97 |
hsa-miR-1260b | 2060.3 | 540.9 | 1270.6 | 1977.9 | 0.26 | 0.43 | 0.27 |
hsa-miR-4286 | 678.8 | 202.4 | 2019.2 | 471.2 | 0.3 | 0.1 | 0.43 |
表1. 微阵列检测分析结果
上述分析结果验证了我们可以利用MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Ago1-4,从Ago1、Ago3、Ago4中提取硅胶珠型产品难以提取的大量microRNA。
使用本品和硅胶珠型产品,提取HeLa细胞(1×107 cells)中的microRNA,以miR-92a作为内部标准,通过qPCR检测miR-22、miR-1、miR-1260b、miR-4286的提取量。结果发现,Ago1、Ago3、Ago4中miR-1260b、miR-4286的提取量比硅胶珠型产品更高(图1)。因此,本品不仅能提取Ago2中的microRNA,还能从Ago1、Ago3、Ago4中提取硅胶珠型产品难以提取的大量microRNA。
图1. 比较从HeLa细胞中提取的各种microRNA量
提取人和小鼠细胞株中的microRNA
以qPCR对miR-92a进行定量,比较用本品和硅胶珠型产品(microRNA Isolation Kit, Human Ago2或Mouse Ago2)从人K562细胞(1×107 cells)及小鼠P388D1细胞(2×107 cells)中提取的microRNA量。结果显示,本品可提取和硅胶珠型产品相同甚至更多的microRNA(图2,3)。
图2. 比较从人K562细胞中提取的microRNA量
图3. 比较从小鼠P388D1细胞中提取的microRNA量
提取人和大鼠血浆中的游离Ago结合microRNA
以qPCR对miR-92a进行定量,比较用本品和第一代产品(microRNA Isolation Kit, Human Ago2或Mouse Ago2)从200 μL人以及大鼠血浆中提取的microRNA量。结果显示,本品可提取和硅胶珠型产品相同甚至更多的microRNA(图4,5)。
图4. 比较从人血浆中提取的microRNA量
图5. 比较从大鼠血浆中提取的microRNA量
提取各种动物细胞株中的microRNA
以qPCR对miR-92a进行定量,检测用MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Human Ago2、Mouse Ago2、Ago1-4从2×106 cells的K562细胞(人)、COS-7细胞(猴)、MDCK细胞(狗)、P388D1细胞(小鼠)、SCC-131细胞(大鼠)中提取的免疫沉淀组分中的microRNA量,和用ISOGEN® 从各种细胞中提取的total RNA组分中的microRNA量。通过比较各种免疫沉淀所得到的RNA组分中的miR-92a量和total RNA组分中的miR-92a量的相对值,表明本品适合提取上述全部细胞中的microRNA(图6)。
图6. 比较从各种动物细胞中提取的microRNA量
◆MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Protein G使用例子
提取人和小鼠细胞株中的microRNA(与硅胶珠型产品的比较)
以qPCR法对miR-92a进行定量,比较用本品(MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Protein G)和抗Ago1抗体(2A7)、抗人Ago2抗体(4G8)、抗人Ago3抗体(1C12)从人K562细胞(1×107 cells)提取的microRNA量,和用硅胶珠型产品(microRNA Isolation Kit, Human/Mouse Ago1、Human Ago2、Human Ago3)提取的micro RNA量(图1,2,3,)。另外,以qPCR对miR-92a进行定量,比较用本品和抗小鼠Ago2抗体(2D4)从小鼠P388D1细胞(2×107 cells)中提取的microRNA量,和用硅胶珠型产品(microRNA Isolation Kit, Mouse Ago2)提取的microRNA量(图4)。结果发现,本品与任意抗Ago抗体结合使用,能比硅胶珠型产品提取到更多的microRNA。
图1. 比较结合了抗Ago1抗体时的microRNA提取量
图2. 比较固定抗人Ago2抗体时的microRNA提取量
图3. 比较固定抗人Ago3抗体时的microRNA提取量
图4. 比较固定抗小鼠Ago2抗体时microRNA的提取量
提取人与小鼠细胞株中各种Ago蛋白结合microRNA
通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和qPCR,对用本品和抗Ago1抗体(2A7)、抗人Ago2抗体(4G8)、抗人Ago3抗体(1C12)、抗Ago4抗体(2G7)从人K562细胞(1×107 cells)中提取的miR-92a表达量进行检测(图5)。另外,通过变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和qPCR(miR-92a量),检测用本品和抗Ago1抗体(2A7)、抗小鼠Ago2抗体(2D4)、抗小鼠Ago3抗体(S09)、抗Ago4抗体(2G7)从小鼠P388D1细胞(2×107 cells)中提取的microRNA量(图6)。结果表明,本品与任意的抗Ago抗体组合使用,能提取与各种Ago结合的microRNA。
图5. 从人K562细胞中提取的microRNA量的比较与银染检测
图6. 从小鼠P388D1细胞中提取的microRNA量的比较与银染检测
◆产品列表
产品编号 | 产品名称 | 使用 抗体 克隆号 | 对应 物种 | 对应样本 | 提取RNA | IP B/F | RNA |
MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Human Ago2 分离试剂盒,人Ago2 | 4G8 | 人、猴、狗 | 细胞/ 组织 血浆 | microRNA | 磁力 分离 | 离心 柱法 一步法 | |
MagCapture™ microRNA Isolation Kit,Mouse Ago2 分离试剂盒,小鼠Ago2 | 2D4 | 小鼠、大鼠、狗 |
产品编号 | 产品名称 | 产品规格 | 产品等级 | 备注 |
295-74001 | MagCapture™ microRNA Isolation Kit, Human Ago2 MagCapture™microRNA分离试剂盒,人Ago2 |
10 tests | for Genetic Research | - |
297-74201 | MagCapture™ microRNA Isolation Kit,Mouse Ago2 MagCapture™microRNA分离试剂盒,小鼠Ago2 |
10 tests | for Genetic Research | - |
免责声明 |
1. 本公司密切关注本网站发布的内容,但不保证发布内容的准确性、完整性、可靠性和最新性等。 2. 本公司不保证使用本网站期间不会出现故障或计算机病毒污染的风险。 3. 无论何种原因,使用本网站时给用户或第三方造成的任何不利或损害,本公司概不负责。此外,对于用户与其他用户或第三方之间因本网站发生的任何交易、通讯 3. 或纠纷,本公司概不负责。 4. 本网站可提供的所有产品和服务均不得用于人体或动物的临床诊断或治疗,仅可用于科研等非医疗目的。如任何用户将本网站提供的产品和服务用于临床诊断或治 4. 疗,以及其他特定的用途或行为,本公司概不保证其安全性和有效性,并且不负任何相关的法律责任。 |