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RiboNAT™ 快速无菌检测试剂盒

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在注射用药的安全性检测中,多国药典规定的无菌检测法至少需培养14天。然而,某些细胞治疗必须在生产后的几天内输注给患者,这使得在给药前完成无菌检测变得困难,这也导致了对能更快提供结果的无菌检测方法的需求日益增长,以提升患者安全性‌。

RiboNAT™ 是一款采用核酸扩增检测(NAT)技术的快速无菌检测试剂盒,能够在短短7 小时内完成检测,与传统方法相比大幅缩短了检测时间。与传统NAT检测只针对微生物的基因组DNA不同,RiboNAT™检测的是核糖体RNA(rRNA)。由于rRNA在微生物中含量较高,这使检测更加灵敏。同时,传统方法容易因死菌残留DNA或环境及材料中的污染DNA导致假阳性,而RiboNAT™ 有效减少了这一问题,提高了检测的准确性。



◆特点


● 检测当日即可获取结果(约7 小时)

● 使用rRNA实时逆转录PCR法(RT-rt PCR)检测,灵敏度(9 CFU/mL)高于gDNA检测

● 降低死菌和残留DNA导致的假阳性

● 单次可同时检测多种细菌(需氧和厌氧)和真菌



◆实验流程


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◆检测试剂盒规格


  原理

  使用荧光探针的One step实时逆转录PCR法

  灵敏度

  100 RNA copies/reaction

  引物/探针序列覆盖率*

  细菌:25,748种(95.7%);
  真菌:1,683种(92.3%)
  *In silico分析,允许3次错配,数据库:Sliva

  目标序列

  细菌:23S Ribosomal RNA(检测波长:515-530 nm)

  真菌:25/28S Ribosomal RNA(检测波长:675-690 nm)

  Internal Control(内标):合成序列(检测波长:560-580 nm)



◆试剂盒组成

■ RNA Isolation Kit 1

 (RNA分离提取试剂盒1)


■ RNA Isolation Kit 2

 (RNA分离提取试剂盒2)

■ Detection Kit

 (RNA检测提取试剂盒)

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① 酶促增强剂

② 活化剂1(SCDM)

③ 活化剂2(TG)×2

④ 核酸灭活剂

⑤ DNase溶液

⑥ 1st-DNase缓冲液(1)

⑦ 2nd-DNase缓冲液(2)

⑧ 蛋白酶K溶液

⑨ 酶混合液

① 结合缓冲液

② 1st-清洗缓冲液(1)

③ 2nd-清洗缓冲液(2)

④ 裂解缓冲液

⑤ 裂解增强剂

⑥ 洗脱缓冲液 ×3

⑦ 磁珠

⑧ 样品管 ×2

⑨ 洗脱管

① 水

② 阳性对照 RNA

③ 内标 RNA

④ 检测混合液 ×2



灵敏度检测


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图1. 检测灵敏度

针对药典规定的六种微生物,制备了浓度为9 CFU/mL的微生物悬液。利用RiboNAT™从这些悬液中提取RNA,并检测核糖体RNA(rRNA)。所有微生物的rRNA均成功检出,Ct值均低于35。


检测灵敏度达9  CFU/mL



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图2. 细胞悬液样品中的检测灵敏度

针对药典规定的六种微生物,制备了浓度为9 CFU/mL的微生物悬液,并分别与0.25×106 cells/mL的HEK293细胞混合。利用RiboNAT™从混合悬液中提取RNA,并检测rRNA。所有微生物的rRNA均成功检出,Ct值均低于35。

此外,所有6种菌株在以下条件下也均被检出(数据未显示):

· 间充质干细胞(MSC):0.5×106 cells/mL

· T-cell:1.0×106 cells/mL


细胞悬液样品中的检测灵敏度达9  CFU/mL



◆灵敏度更高的检测法


■ 菌浓度:2 CFU/mL

■ 孵育时间:3~15 h

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图3. 灵敏度更高的检测方法

针对巴西曲霉(Aspergillus brasiliensis)、产孢梭菌(Clostridium sporogenes)和痤疮丙酸杆菌(Cutibacterium acnes),制备了浓度为2 CFU的微生物悬液。虽然RiboNAT™常规操作流程规定的孵育时间为3 小时,但该实验将孵育时间延迟至3-15 小时。孵育结束后,使用RiboNAT™提取RNA,并检测rRNA。结果显示,包括严格厌氧菌(产孢梭菌)和生长缓慢的细菌(痤疮丙酸杆菌)在内的三种菌株,在14小时或更长时间孵育后均成功检出,Ct值均低于35。


经14小时孵育,检测灵敏度可达2 CFU/mL



◆降低假阳性


RiboNAT™ 包含死菌DNA灭活试剂以及DNase处理步骤,可有效降低样品中残留DNA导致的假阳性风险。


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图4. 降低假阳性

使用商业化的无菌PBS作为测试样品,进行细菌核酸检测(NAT)。其中一组实验(上图),使用市售试剂盒提取DNA,随后进行细菌靶向实时荧光定量PCR检测。另一组实验(下图),使用RiboNAT™提取RNA,随后进行实时逆转录荧光定量PCR检测。基于DNA的方法中观察到六条扩增曲线,而使用RiboNAT™未检测到任何扩增信号。


RiboNAT™ 可以降低残留DNA导致的假阳性


FAQ


Q1:测试所需的样品体积是多少?

根据标准流程,总共需要2 mL样品进行离心后用于检测。虽然也可使用更小体积的样品进行检测,但微生物数量减少,检测到微生物的可能性会降低。

 

Q2:一套试剂盒可以检测多少个样品?

每个样品需进行一次RNA提取,每次进行双孔PCR检测(n=2)。除样品外,每次检测还需以下对照:阴性提取对照(1次提取→2 PCR孔)、无模板对照(4 PCR孔)和PCR阳性对照(4 PCR孔)。

RNA提取试剂盒支持50次提取,检测试剂盒支持100 PCR孔反应。

 

Q3:试剂需要一次性全部使用吗?

不需要。使用后请按使用说明于适宜温度保存,并在有效期内使用完毕。

 

Q4:兼容哪些实时PCR仪器?

已验证兼容 CFX96系统(Bio-Rad Laboratories公司)和的QuantStudio® 5实时PCR系统(Thermo Fisher Scientific公司)。其他能够检测指定波长的实时PCR仪器也可能适用。



产品列表
产品编号 产品名称 产品规格 产品等级 备注
291-98401 RiboNAT™ Rapid Sterility Test - RNA Isolation Kit 1
50 Tests 微生物检测用 储存温度:-20°C
297-98001 RiboNAT™ Rapid Sterility Test - RNA Isolation Kit 2 50 Tests 微生物检测用 储存温度:室温
293-98101  RiboNAT™ Rapid Sterility Test - Detection Kit 100 Tests 微生物检测用 储存温度:-20°C

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